黑玉米是一種營養成分較豐富的食物，含有蛋白質、礦物質、膳食纖維等營養成分，一般情況下，適量食用黑玉米不會對人體造成明顯的危害，但是長期過量食用，或長期單一食用，可對人體造成一定的危害，主要有消化不良、營養不良等。
1、消化不良：黑玉米中含有豐富的膳食纖維，而膳食纖維不容易被胃腸道消化和吸收，同時大量攝入會對胃黏膜產生一定的刺激性，嚴重時可損傷為胃黏膜。因此，長期過量食用可能引起消化不良，出現腹痛、腹脹、腹瀉的不適癥狀；
2、營養不良：因黑玉米的主要營養物質是淀粉，而蛋白質以及其他營養成分含量較少，長期單一食用黑玉米，容易導致營養不良。
因此，建議日常適量食用黑玉米即可，以改善胃腸道功能，若長期過量食用或單一食用，則不利于身體健康。