吃藥后孕囊一直沒有排出來可能是用藥不規范、對藥物不敏感、孕囊過小、孕囊過大、異位妊娠等因素導致的，患者需要及時到醫院就診，并且配合醫生對癥治療。
1、用藥不規范：如果用藥順序不對，或是藥量不足，都有可能導致流產失敗。患者在用藥的時候一定要在醫生的指導下，不要隨意減少用藥的劑量。
2、對藥物不敏感：如果患者對藥物流產使用的藥物不夠敏感，就會造成藥物不能起到很好的效果，可能會造成孕囊不能正常排出，這個時候可以在醫生的指導下調整用藥的劑量，也可以改變其他的流產方式。
3、孕囊過小：如果妊娠的時間不長，孕囊又很小，藥物就不能起到很好的效果，所以要在醫生的指導下等一段時間，等孕囊發育到了一定的大小，再進行藥物流產。
4、孕囊過大：如果孕囊較大，藥物流產的成功率就會很低，這時候就應該做刮宮術。
5、異位妊娠：藥物流產使用的藥物主要是針對著床在子宮里的胎囊，所以不能治療異位妊娠。一般可以通過輸卵管妊娠保守性手術、腹腔妊娠剖腹取胎術等方式進行治療。
患者平時需要多休息，避免勞累，可以適量吃一些紅棗、豬肝、鴨血等食物促進身體的恢復。