蟲草花燉雞作為生活中常見的食物，具有補充營養的作用，對于體質較為虛弱的人群有較大好處。通常食用禁忌較少，大部分人可適量食用。但若過量食用，則可能會引起不適癥狀。蟲草花燉雞中含有大量脂肪，而脂肪的消化需要腸液、膽汁參與，大量食用可能會加重胃腸道和膽囊的負擔。尤其對于胃炎、胃潰瘍、膽囊炎和膽石癥的患者，應避免過量吃蟲草花燉雞。
在進食蟲草花燉雞后，由于脂肪的攝入，體內的膽固醇也會升高。如果食用過多蟲草花燉雞，超過人體消化承受能力，含量過高的膽固醇會粘附在血管內膜上，會導致動脈血管收縮能力減弱，血管壁變厚，進而導致動脈硬化、血壓升高。所以高血壓或動脈硬化患者，需避免吃過多蟲草花燉雞。
蟲草花燉雞中還含有較多的蛋白質，其中有部分是小分子蛋白質。若食用過多，超過肝臟、腎臟的處理能力，會導致氮質血癥，所以具有部分基礎腎臟疾病的患者不建議食用蟲草花燉雞。另外蟲草花在中醫上性味甘溫、溫性助熱，若過量食用會導致上火，建議平時食用應注意自己身體狀況，若本身容易上火，則盡量不要食用或少食用。