出現早晨睡覺起來右腎疼的情況，可能是由于腰肌勞損、急性腎盂腎炎、右腎結石、腰椎間盤突出癥等導致的，要根據具體情況進行藥物治療等。
1、腰肌勞損：如果晚上睡覺時的床墊太軟，或者是白天站立過長、彎腰次數過多等，可能會出現腰肌勞損現象，夜間乳酸分泌增多，沒有及時排出，可表現為睡醒后右側腎部疼痛的癥狀。建議減少彎腰次數，避免長時間站立，同時還要多注意睡覺，不能睡太軟的床，一般可以逐漸改善癥狀。如果疼痛癥狀較嚴重，則可以在醫生指導下使用布洛芬、塞來昔布等藥物治療。
2、急性腎盂腎炎：是由病原體感染腎盂、腎小管和腎間質引起的急性化膿性炎癥，其典型特點是腎區疼痛，如果疾病發生在右側腎部，夜間新城代謝減慢，可導致炎癥因子蓄積在某一部位，則可出現上述現象，還可能會伴有寒戰、發熱、尿頻、尿急的癥狀。建議在醫生指導下使用鹽酸左氧氟沙星片、阿莫西林膠囊等藥物治療。
3、右腎結石：患有右腎結石的患者，結石增大或睡覺時結石活動，也會對黏膜造成刺激，導致睡醒后腎區痛的癥狀。建議多喝水、多運動，還可遵醫囑使用排石顆粒等藥物，促進結石排出，如果疼痛癥狀較嚴重，還可以采取體外沖擊波碎石等方法治療。
4、腰椎間盤突出癥：是指由腰椎間盤的退變為基礎，在外力影響下出現纖維環破裂，造成髓核突出而壓迫神經根，睡姿不當可能會出現右側腰疼的癥狀。疼痛較嚴重時，可能會放射至右側腎區，患者可能會在清晨起床時感到腎部酸痛的癥狀。一般可以在醫生的指導下應用布洛芬緩釋膠囊、塞來昔布膠囊等藥物治療，還可以通過手術的方式進行治療，如腰椎間盤突出切除術、椎間盤鏡髓核摘除術等。
除以上情況外，也可能是右腎腫瘤導致。如果患者的右腎存在腫瘤，由于病情不斷進展，隨著腫瘤體積的增大和壓迫，也有可能會出現局部疼痛癥狀，此現象也可出現在早晨醒來時。一般建議采取手術切除治療，術后可能還需要配合放、化療等方法綜合治療。
出現上述現象后，建議患者及時到醫院腎內科就診，進行血常規、腎臟B超等檢查，以明確具體情況，并積極進行治療。在日常生活中要注意飲食調整，適當運動，但不要進行過于激烈的運動。