此處的萎縮通常指胃黏膜萎縮。奧美拉唑吃半年，一般不會導致胃黏膜萎縮，需嚴格遵醫囑吃奧美拉唑，不能自行盲目用藥。
長期吃奧美拉唑可能有一些不良反應，每個人吃藥物以后，不良反應不完全相同。有的人可能會出現腹脹、腹瀉以及便秘、惡心、嘔吐等癥狀，有的人可能會有頭痛、抑郁、精神錯亂或過敏的癥狀，長期吃藥還有可能導致肝腎功能損害。奧美拉唑屬于質子泵抑制劑，可抑制胃酸分泌，緩解燒心、胃部疼痛等胃酸相關的癥狀，但沒有導致胃黏膜萎縮的作用。
胃黏膜萎縮通常與幽門螺桿菌感染導致萎縮性胃炎有關，長期吃布洛芬片、美洛昔康片等非甾體類消炎藥，也可導致胃黏膜損傷，引起萎縮性胃炎。此外，有煙酒嗜好的人群，煙酒刺激有可能導致胃黏膜受到損傷，引起胃黏膜萎縮。