油菜花粉的副作用主要有腸胃道反應和過敏反應，可以通過藥物進行治療。
油菜花粉是我國中醫傳統的中藥材之一，主要功效是散血消腫，對瘡癰有一定的治療效果，還有提高人體免疫力的作用，油菜花粉本身無毒，但含有豐富的油脂，因此過量食用，可能會對腸胃道產生一定的刺激，出現如惡心、嘔吐等不良反應，建議患者適量食用，如果出現腸胃道反應，應停止服用并適量補水，減輕胃腸道的不適癥狀。
部分人群可能會對油菜花粉有過敏現象，出現如皮疹、紅腫等過敏反應，建議患者在出現過敏反應時應立即停服，可以口服氯雷他定類藥物進行抗過敏治療，如果服藥后過敏反應或癥狀沒有減輕甚至出現加重的，患者應及時就醫，同時油菜花粉不是藥物，只具有保健功效，不能替代藥物進行治療，對于腸胃道消化功能較差的患者，服用前最好先咨詢專業醫生，避免對身體健康造成影響。