關于懷孕時間的計算，通常有兩種方式：一種是從末次月經的第一天開始計算，另一種則是根據胚胎發育情況推算。這兩種方式都有其合理性，但醫學上更常用的是從末次月經開始計算的時間，這是因為排卵和受精的時間往往難以精確確定。B超檢查顯示的孕囊大小（1.1cm×0.5cm）通常與約29天的懷孕時間相符，這是從末次月經開始計算的標準時間。
然而，有些情況下，特別是如果排卵延遲或胚胎發育較慢時，可能會出現一定的差異。因此，醫生通常會結合B超結果和其他檢查指標（如血液中的激素水平）來綜合判斷孕周。
如果你的朋友認為已經懷孕40天，這可能是基于其他因素的估算，但醫學上更傾向于末次月經開始計算的時間作為參考標準。建議你與主治醫生詳細溝通，了解具體情況，并根據專業意見進行后續檢查和隨訪。
總之，懷孕時間的計算需要綜合考慮多種因素，不能單純依賴一種方法。如果你有任何疑問或困惑，最好及時咨詢專業的醫療人員以獲得準確的指導。