睡覺覺醒障礙遺尿可以通過服用藥物、行為訓練、放松身心等方式進行治療。
1、服用藥物：目前治療睡眠覺醒障礙遺尿的藥物有丙米嗪、去氨加壓素等藥物，不過因為癥狀不同，藥物的使用量不同，所以服用前要咨詢醫生。
2、行為訓練：可以采取憋尿、訓練尿中斷訓練方法提高膀胱憋尿時間，如排尿時不全部排空，中斷排尿提高憋尿能力。此外睡前要排尿，排空膀胱可以減少遺尿次數。
3、放松身心：因為睡眠覺醒障礙遺尿大部分發生在兒童身上，一些父母會訓斥兒童，但這樣會讓他們心理更加緊張，所以不要訓斥，要消除兒童精神緊張感，避免情緒不安。此外在白天要避免兒童過于興奮，避免與他人出現打架沖突等行為影響兒童身心。如果是成人注意保持白天的情緒穩定，避免看過于刺激的影視作品和書籍。
注意睡眠覺醒障礙遺尿易引發尿路感染，一旦出現尿路感染要及時服用抗感染藥物，如左氧氟沙星、諾氟沙星等。而且在服用藥物期間要多喝水，多排尿，多休息，避免過于勞累，勞累不僅不利于疾病治療，還會增加遺尿次數。