指甲粗糙、凹凸不平可能是甲癬、銀屑病、甲營養不良等原因導致的，患者需要對癥治療，具體內容如下：
1.甲癬：平時不注意個人衛生、長期接觸化學物質、真菌感染等因素容易誘發甲癬，造成指甲表面受損，表現為甲板萎縮、分離、增厚以及表面凹凸不平等。患者可以在醫生指導下外用鹽酸特比萘芬乳膏、聯苯芐唑乳膏、硝酸舍他康唑乳膏等藥膏治療。
2.銀屑病：遺傳、環境污染等因素容易造成皮膚異常，導致銀屑病，主要表現為皮膚干燥破裂，如果表現在指甲的位置，可能會出現甲分離、指甲凹凸不平的情況。患者可以在醫生指導下使用他扎羅汀凝膠、地蒽酚軟膏、喜樹堿軟膏等藥物進行治療。
3.甲營養不良：遺傳基因、飲食習慣不良等因素容易造成甲營養障礙，導致甲營養不良，主要表現為指甲變得渾濁、易碎，并且伴隨粗糙、凹凸不平的情況。患者可以在醫生指導下使用硝酸咪康唑乳膏、維生素C片、復合維生素B片等藥物進行治療。