腘窩囊腫可以通過觀察、保守治療、手術治療等方式改善，而具體的治療方案需要結合患者的病情輕重程度判斷。
1、觀察：
腘窩囊腫通常是指患者出現了囊性軟組織腫塊，會導致患者膝后部出現疼痛和腫脹情況，同時也可能會導致患者患處出現彈性的軟組織腫塊，當患者癥狀不是特別嚴重時，一般不需要給予特殊治療，隨時觀察在短時間內不要做過于劇烈運動即可。
2、保守治療：
腘窩囊腫在通過觀察之后，如果癥狀出現了加重，需要選擇超聲引導抽吸囊液，且還需遵醫囑應用皮質類固醇藥物給予治療，其中包括吲哚美辛片、塞來昔布膠囊、布洛芬緩釋片等。
3、手術治療：
腘窩囊腫在保守治療六周以內，自身的癥狀沒有得到改善，甚至還出現了血管以及神經壓迫癥狀，需要及時到醫院做全方面檢查，經過檢查之后可以通過傳統開放手術或者是關節鏡手術的方式治療。
經過手術治療后患者需要適當的休息，在自身傷口緩慢愈合后，可以適當的下地走路，同時還需要積極的做康復訓練，可以促使自身的關節功能逐漸的恢復。