南瓜籽和葵花籽脂肪含量相差不多，每100克南瓜籽中大約含有45克脂肪，每100克葵花籽中大約含有47克脂肪。嚴格來講可能葵花籽的脂肪含量更高一些，但是高出范圍并不明顯。
南瓜籽和葵花籽的營養成分都比較豐富，含有多種蛋白質、不飽和脂肪酸、卵磷脂以及礦物質，可以為人體提供營養，適當吃對人體健康有一定好處。由于脂肪含量大致相同，所以并不需要為了減少脂肪攝入量而過分追求其中一種。就人們日常生活的正常飲食而言，并不會因為單純攝入南瓜籽或葵花籽而導致肥胖，所以建議廣大人群依據自身喜好和實際情況進行選擇即可。
但需要注意的是南瓜籽和葵花籽都屬于熱量相對比較高的食物，所以建議少吃，以免體內熱量聚集，如果不能被人體消耗，會轉化為脂肪堆積在身體各處，進而對體重造成影響。