大拇腳指甲黑紫而且疼可能是外力擠壓、甲溝炎、甲下出血、甲癬、甲母痣等因素引起的，建議患者及時前往正規醫院就診檢查，通過日常護理、藥物治療、手術治療的方式進行處理。
1、外力擠壓：鞋子過緊或受到外力撞擊等可能導致大拇腳趾甲受擠壓，出現黑紫且疼的情況。通常伴有局部腫脹。處理方式是穿著寬松舒適的鞋子，避免再次擠壓，一般無需用藥，可進行局部冷敷緩解疼痛和腫脹。
2、甲溝炎：細菌感染甲溝可引發甲溝炎，導致指甲周圍紅腫、疼痛，嚴重時可波及指甲，使指甲出現黑紫。可能伴有膿性分泌物。患者要保持指甲周圍清潔，避免沾水，可在醫生指導下外用莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏、魚石脂軟膏等，疼痛嚴重時可口服阿莫西林膠囊、頭孢克肟膠囊、羅紅霉素膠囊等抗生素。
3、甲下出血：外傷等原因可引起甲下出血，使大拇腳趾甲呈現黑紫，一般疼痛較輕，可能隨著指甲生長逐漸消退。患者要避免劇烈運動，防止再次受傷，無需特殊用藥，可觀察其變化。
4、甲癬：真菌感染指甲引起甲癬，可使指甲變色、增厚、變形，嚴重時可出現黑紫且疼痛，可能伴有指甲分層、易碎等癥狀。患者可在醫生指導下外用阿莫羅芬搽劑、環吡酮胺乳膏、鹽酸特比萘芬乳膏等抗真菌藥物。
5、甲母痣：病因不明，可能與遺傳、外傷等因素有關，表現為大拇腳趾甲上一條或多條黑褐色縱行條紋，當甲母痣惡變時可出現疼痛、黑紫范圍擴大等癥狀。如果懷疑甲母痣惡變，需要進行手術切除，如拔甲術聯合病理檢查、甲母痣切除術等。
此外，患者在日常生活中要注意保護腳部，避免受傷和感染。