亞麻籽和火麻仁的區別主要包括功效、主治、禁忌等不同等。
1、功效：亞麻籽味甘，性平，具有養血祛風、潤燥通便的功效。火麻仁味甘，性平，歸脾、胃、大腸經，具有潤腸通便的功效。
2、主治：亞麻籽主要用于治療皮膚干燥瘙癢、腸燥便秘、咳嗽氣喘、瘡瘍濕疹、麻風等病癥。火麻仁多用于腸燥便秘、足癬等。
3、禁忌：亞麻籽的禁忌主要是大便滑泄者禁服，孕婦慎服，以免引起不適反應，不利于機體健康。火麻仁的禁忌是脾虛便溏及陽虛滑泄者不宜用，并且大量服用會引起中毒，對機體造成損傷。
除上述常見區別外，還包括注意事項、化學成分、藥理作用等不同。上述藥物都不應自行使用，應該在醫生指導下根據具體病情進行使用。